。2005年帮助球队杀进亚冠四强 。
2006年，转会厦门蓝狮足球队。
2008年，杨晨正式退役。
教练生涯
2008年，杨晨顺利通过了教练员资格培训 。
2009年，取得教练员资格证的杨晨重新回到球迷的眼前，加盟江苏舜天担任助理教练。迈开了作为教练员的第一步。
2010年，杨晨选择去德国学习，参加国际A级教练员进修。
2011年，舜天时任主教练柯西安因成绩不佳下课的情况下，杨晨一度成为临时主帅。德拉甘到来后，杨晨成为其助手，担任江苏舜天足球俱乐部领队兼助理教练。
2013年11月5日，有消息传出，从上午宣布德拉甘教练被解职后，杨晨递交了辞职报告，同日，国信舜天董事长龚建人离职。
2013年12月，杨晨同贵州人和俱乐部签约，担任领队及第一助理教练。
2014年10月4日，贵州人和在客场以0比1不敌广州富力，此役过后，人和陷入联赛五轮不胜的尴尬。此外，人和主帅朱炯因在下半时第80分钟左右时抱怨裁判而被罚上看台，领队杨晨出席了赛后的新闻发布会。
2015年回归北京出任北控足球俱乐部的领队和助理教练 。2015年10月，北控在足协杯半决赛首回合客场2比3惜败上海申花。上半场结束前，北控领队杨晨被罚上看台 。
个人生活
婚姻家庭
2006年，杨晨迎娶舞蹈演员刘珊珊 。
刘珊珊是一名舞蹈演员，工作于总政文工团。其实早在06年中秋节时，杨晨的女友就亮相厦门，并参加了蓝狮队中秋博饼的活动。当时记者曾希望拍下杨晨与女友在一起的照片，但杨晨一再交代，不要让自己的女友曝光，让读者错过了一睹杨太太的机会。在活动现场，杨晨的女友看起来非常年轻，身材苗条，性格活泼，杨晨对女友关爱有加，两人十分亲密 。
杨晨的儿子2007年出生。
解说活动
2015年11月，詹俊搭档杨晨在新浪解说了亚洲冠军联赛决赛。
2016年欧洲杯期间，杨晨曾出任央视解说嘉宾。
2018年5月15日，中央电视台公布2018年俄罗斯世界杯解说阵容，五名解说员分别是贺炜、洪钢、朱晓雨、刘嘉远和曾侃。两名前国脚徐阳和杨晨将作为嘉宾。